1、VTE與sCOVID-19的關(guān)系

作者使用IVW方法，證明了VTE與sCOVID-19之間存在因果關(guān)系（p=0.018338555）（表格1)。

2、敏感性分析

多效性檢驗(yàn)結(jié)果表明不存在水平SNP多效性（表2)。此外，LOO分析結(jié)果與IVW分析結(jié)果相似，表明數(shù)據(jù)可靠性較高（圖2）。綜合起來，上述結(jié)果表明，VTE對sCOVID-19有很強(qiáng)的促進(jìn)作用。

3、主要sCOVID-19相關(guān)基因的鑒定及功能富集分析

作者在GSE145926數(shù)據(jù)集中鑒定了37個SNP相關(guān)基因，其中，sCOVID-19與健康對照之間存在15個DEG，其中包括10個在sCOVID-19中高表達(dá)的基因（ACSS2、CYP4V2、EIF6、GBGT1、GSS、MADD、MAPK8IP1、MYBPC3、NT5DC3和SURF6）和5個幾乎不表達(dá)的基因（CEP250、DDB2、MMP24、PROCR和YIPF2）（圖3)。為了進(jìn)一步闡明這些DEG在sCOVID-19中的潛在生理功能，作者進(jìn)行了單基因GSEA（圖4）。

鑒于sCOVID-19病理生理學(xué)與IME之間存在很強(qiáng)的潛在關(guān)聯(lián)，接下來通過檢查28種免疫相關(guān)細(xì)胞的表達(dá)譜來探索sCOVID-19患者的IME。結(jié)果發(fā)現(xiàn)sCOVID-19與對照樣本中有15種免疫細(xì)胞豐度存在顯著差異（圖5A)，即sCOVID-19中的適應(yīng)性免疫反應(yīng)細(xì)胞（例如活化的CD8T細(xì)胞、活化的樹突狀細(xì)胞、自然殺傷細(xì)胞、效應(yīng)記憶CD4T細(xì)胞、效應(yīng)記憶CD8T細(xì)胞、未成熟B細(xì)胞等）明顯減少，而炎癥和髓系細(xì)胞（例如中性粒細(xì)胞、嗜酸性粒細(xì)胞和巨噬細(xì)胞等）明顯增多。接下來，作者證明了主要基因與差異免疫細(xì)胞之間的緊密關(guān)聯(lián)。特別是，5個很少表達(dá)的DEG（CEP250、DDB2、MMP24、PROCR和YIPF2）與適應(yīng)性免疫細(xì)胞直接相關(guān)。相反，10個高表達(dá)基因（ACSS2、CYP4V2、EIF6、GBGT1、GSS、MADD、MAPK8IP1、MYBPC3、NT5DC3和SURF6）與炎癥和髓系細(xì)胞直接相關(guān)（圖5B）。此外，還證實(shí)了7個免疫相關(guān)網(wǎng)絡(luò)的得分存在顯著差異，即檢查點(diǎn)、細(xì)胞溶解活性、HLA、炎癥促進(jìn)、MHC_class_I、T_cell_co-inhibition和T_cell_co-stimulation（圖5C）。根據(jù)結(jié)果分析，5個很少表達(dá)的DEG與檢查點(diǎn)、細(xì)胞溶解活性和T細(xì)胞共抑制網(wǎng)絡(luò)呈正相關(guān)。相反，10個高表達(dá)的DEG與MHC_class_I和T細(xì)胞共刺激網(wǎng)絡(luò)直接相關(guān)（圖5D）。總之，這些發(fā)現(xiàn)表明DEG對于sCOVID-19IME至關(guān)重要。

5、DEG與免疫病理學(xué)特征密切相關(guān)

為了進(jìn)一步研究DEG與sCOVID-19免疫病理學(xué)特征之間的關(guān)聯(lián)，進(jìn)行了以下分析。就MHC基因集而言，發(fā)現(xiàn)3個DEG（B2M、HLA-A和TAPBP）在sCOVID-19中與對照樣本相比明顯上調(diào)。相比之下，12個DEG（HLA-C、HLA-DMA、HLA-DMB、HLA-DOA、HLA-DPA1、HLA-DPB1、HLA-DQA2、HLA-DQB1、HLA-DRA、HLA-DRB1、HLA-E和TAP2）顯示出相反的趨勢（圖6A）。還證明了B2M、HLA-A和TAPBP基因與5個顯著降低的DEG（CEP250、DDB2、MMP24、PROCR和YIPF2）呈負(fù)相關(guān)（圖6B)。在免疫激活劑的情況下，與正常樣本相比，sCOVID-19中的CD40、IL6R和MICB明顯上調(diào)。相反，CD28、CD40LG、CD48、ICOS、ULBP1和LTA含量表現(xiàn)出相反的反應(yīng)（圖6C）此外，還發(fā)現(xiàn)CEP250、DDB2、MMP24、PROCR和YIPF2含量與大多數(shù)下調(diào)的免疫激活因子直接相關(guān)（圖6D)。最后，在免疫抑制劑方面，sCOVID-19中的CSF1R、IDO1和TGFBR1含量與正常樣本相比顯著升高。相反，CD96和LAG3水平顯示出相反的趨勢（圖6E）。此外，CEP250、DDB2、MMP24、PROCR和YIPF2含量與CD96和LAG3水平直接相關(guān)（圖6F）。